
Как подружить миллионы клеток: CONCORD наводит порядок в хаосе одиночных клеток
Что такое CONCORD, зачем он нужен в анализе одиночных клеток и почему контрастивное обучение внезапно стало лучшим другом биологов.

Что такое CONCORD, зачем он нужен в анализе одиночных клеток и почему контрастивное обучение внезапно стало лучшим другом биологов.

Разбираемся, как модель GITIII из Nature Machine Intelligence относится к клеткам как к словам, учится без разметки на графах и восстанавливает карты межклеточных взаимодействий в мозге и опухолях на уровне отдельных клеток.

В Nature Machine Intelligence представили scDiffEq — генеративную модель на нейронных стохастических дифференциальных уравнениях, которая учится одновременно «дрейфу» и «шуму» в одноклеточных данных, точнее восстанавливает траектории и предсказывает судьбу клеток, а также правдоподобно имитирует CRISPR-пертурбации.

CellWhisperer соединяет транскриптомы и текст в одном пространстве и позволяет исследовать single-cell данные через чат — быстро, интуитивно и без строк кода.

Почему scLLM пока буксуют в биомедицине и что поможет превратить их из витринной технологии в рабочий инструмент: стандарты данных, честные бенчмарки, интерпретация, приватность и доступные вычисления.