Как подружить миллионы клеток: CONCORD наводит порядок в хаосе одиночных клеток
Что такое CONCORD, зачем он нужен в анализе одиночных клеток и почему контрастивное обучение внезапно стало лучшим другом биологов.
Биоинформатика
Как подслушать будущее клетки: scDiffEq и нейродиффуры в деле
В Nature Machine Intelligence представили scDiffEq — генеративную модель на нейронных стохастических дифференциальных уравнениях, которая учится одновременно «дрейфу» и «шуму» в одноклеточных данных, точнее восстанавливает траектории и предсказывает судьбу клеток, а также правдоподобно имитирует CRISPR-пертурбации.
Exai‑1: как ИИ научился разговаривать с РНК в капле крови
Exai‑1 — мультимодальная модель‑«переводчик» клеточно‑свободной РНК: она объединяет сведения о последовательностях и уровнях cfRNA, восстанавливает пропущенные сигналы, убирает шум, генерирует синтетические профили и переносит знания между плазмой и сывороткой, помогая строить более точные и устойчивые диагностические тесты жидкой биопсии.
Шёпот клеток: как ИИ научил транскриптомы разговаривать
CellWhisperer соединяет транскриптомы и текст в одном пространстве и позволяет исследовать single-cell данные через чат — быстро, интуитивно и без строк кода.
SaprotHub: белковые языковые модели для каждого исследователя
SaprotHub и ColabSaprot снимают барьеры в обучении и применении белковых языковых моделей: интуитивные ноутбуки в Google Colab, открытый код, централизованное хранилище и поиск тонко настроенных моделей на Hugging Face — все для совместной работы, быстрой проверки гипотез и воспроизводимости в биоинформатике.